14 Mayıs’ta Süleyman Soylu’nun milletvekili olmasının ardından İçişleri Bakanlığına getirilen Ali Yerlikaya’nın en ses getiren operasyonu 8 Eylül 2023’te Ayhan Bora Kaplan’a düzenlenen operasyonuydu. Ankara Emniyet Müdür Yardımcısı Murat Çelik, Organize Suçlarla Mücadele Şube Müdürü Kerem Gökay Öner ve Şube Müdür Yardımcısı Şevket Demircan tarafından yapılan operasyonda eski İçişleri Bakanı Süleyman Soylu’nun ekibinde yer alan esi Ankara Emniyet Müdürü Servet Yılmaz’ın iki yardımcısı Alp Aslan ile Oben Özay’ın da arasında bulunduğu dokuz polis açığa alındı.
Davada gizli tanık olarak yer alan Ayhan Bora Kaplan çetesinden Serdar Sertçelik yalan ve iftiralarla dolu 19 sayfalık beyanları kendisine zorla imzalattırıldığını ileri sürerek Ankara polisini suçladı. Sertçelik yurt dışına çıktıktan sonra polisin kendisine ulaşarak Süleyman Soylu, Bekir Bozdağ, Fahrettin Koca, Abdulhamit Gül, Mücahit Arslan ve Hasan Doğan aleyhine ifade verdirmek istediğini, hükümete bu yolla darbe yaptıklarını ileri sürdü. Ankara Emniyeti’nde patlak veren gizli tanık skandalı MHP lideri Devlet Bahçeli tarafından ‘hükümete darbe girişimi’ olarak değerlendirildi. Dönemin Ankara Emniyet Müdür Yardımcısı Murat Çelik, Organize Şube Müdürü Kerem Öner, Müdür Yardımcısı Şevket Demircan ve Komiser Ufuk Gültekin ‘darbe’ iddiasıyla gözaltına alındı. Çelik ve Demircan soruşturma sırasında tutuklandı, daha sonra serbest bırakılmıştı.
Adli sürecin devam ettiği dönemde İçişleri Bakanlığı, olayın detaylarını araştırmak üzere müfettiş görevlendirdi. Ayhan Bora Kaplan’ı yakalayan ekipte yer alan ve görevden el çektirilen polis Çelik, Demircan ve Gültekin’e iyi haber geldi. Üç polis Personel Şube Müdürlüğü’nde görevlendirildi. T24’ün haberine göre soruşturma kapsamında açığa alınan polis müdürleri İçişleri Bakanı Ali Yerlikaya’nın talimatıyla görevlerine döndü. Üç müdürün ilerleyen günlerde eski pozisyonlarına ya da benzer bir göreve atanabileceği belirtildi. Kararın Ayhan Bora Kaplan’ın 68 yıl hapis cezası almasından sonra gelmesi de dikkat çekti.