2022 yazında Cagliari’den Fenerbahçe’ye 4.7 milyon Euro bonservis bedeliyle transfer olan Joao Pedro’nun sözleşmesi karşılıklı anlaşarak sonlandırıldı. Fenerbahçe’den konuya ilişkin şu açıklama yapıldı: “Profesyonel Futbol A Takımı futbolcularından João Pedro ile karşılıklı olarak anlaşmaya varılmış ve sözleşmesi feshedilmiştir. Oyuncuya kariyerinde başarılar dileriz.”
Bir önceki sezonu Gremio’da kiralık geçiren Brezilyalı futbolcunun Fenerbahçe’yle bu sezonun sonuna kadar sözleşmesi bulunuyordu. Çubuklu formayı 28 maçta terleten Pedro beş gol atıp bir de asist yapma başarısı göstermişti.